Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nkx6-3Q3UHX8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nkx6-3Q3UHX8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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