Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc58Q3UGP9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrc58Q3UGP9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms