Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Garem1Q3UFT3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Garem1Q3UFT3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms