Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Fam35aQ3UEN2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms