Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trafd1Q3UDK1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms