Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf166Q3U9F6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf166Q3U9F6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf166Q3U9F6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf166Q3U9F6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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