Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cops9Q3U898 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cops9Q3U898 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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