Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf149Q3U2C5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf149Q3U2C5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf149Q3U2C5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf149Q3U2C5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rnf149Q3U2C5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Rnf149Q3U2C5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf149Q3U2C5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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