Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms