Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Srsf6Q3TWW8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Srsf6Q3TWW8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms