Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gtf3c3Q3TMP1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gtf3c3Q3TMP1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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