Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc10Q3TLI0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms