Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smarca4Q3TKT4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smarca4Q3TKT4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms