Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RubcnlQ3TD16 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms