Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc69Q3TCJ8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc69Q3TCJ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms