Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc127Q3TC33 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc127Q3TC33 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms