Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem248Q3TBN1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms