Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prr27Q3SYJ2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prr27Q3SYJ2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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