Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M3Q31093 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M3Q31093 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms