Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nlrp1aQ2LKU9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrp1aQ2LKU9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms