Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
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Shroom4Q1W617 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Shroom4Q1W617 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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Shroom4Q1W617 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Shroom4Q1W617 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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