Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptcd3Q14C51 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
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Ptcd3Q14C51 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ptcd3Q14C51 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Ptcd3Q14C51 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptcd3Q14C51 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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