Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gli2Q0VGT2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gli2Q0VGT2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gli2Q0VGT2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gli2Q0VGT2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gli2Q0VGT2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gli2Q0VGT2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gli2Q0VGT2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gli2Q0VGT2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gli2Q0VGT2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms