Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Col19a1Q0VF58 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Col19a1Q0VF58 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms