Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rundc1Q0VDN7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms