Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Itgb8Q0VBD0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms