Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata18Q0P557 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata18Q0P557 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms