Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TrioQ0KL02 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TrioQ0KL02 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms