Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf541Q0GGX2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf541Q0GGX2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms