Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pate4Q09098 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms