Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cass4Q08EC4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cass4Q08EC4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms