Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms