Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tff1Q08423 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tff1Q08423 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tff1Q08423 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tff1Q08423 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tff1Q08423 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tff1Q08423 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Tff1Q08423 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tff1Q08423 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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