Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cntn3Q07409 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms