Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nfe2Q07279 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms