Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gdf9Q07105 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms