Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Siah2Q06986 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms