Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Caprin2Q05A80 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Caprin2Q05A80 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms