Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms