Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms