Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cacna1sQ02789 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cacna1sQ02789 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms