Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ctnnb1Q02248 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms