Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd1Q01822 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms