Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HmgcrQ01237 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HmgcrQ01237 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms