Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SelpQ01102 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SelpQ01102 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms