Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Grin2cQ01098 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Grin2cQ01098 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms