Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VegfaQ00731 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VegfaQ00731 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms