Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SeleQ00690 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SeleQ00690 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms