Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stx2Q00262 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms