Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp9bP98195 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp9bP98195 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp9bP98195 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp9bP98195 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp9bP98195 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp9bP98195 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp9bP98195 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp9bP98195 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms